一、進水壓力：進水壓力本身并不會影響鹽透過量，但是進水壓力升高使驅動反滲透的凈壓力升高，產水量加大，同時鹽透過量幾乎不變，增加的產水量稀釋了透過膜的鹽分，降低了透鹽率，提高脫鹽率。當進水壓力超過一定值時，由于過高的回收率，加大濃差極化，又會導致鹽透過量增加，抵消增加的產水量，使得脫鹽率不再增加。
二、進水溫度：溫度對反滲透的運行壓力、脫鹽率、壓降影響最為明顯。溫度上升，滲透性能增加，在一定水通量下要求的凈推動力減少，因此實際運行壓力降低。同時溶質透過速率也隨溫度的升高而增加，鹽透過量增加，直接表現為產品水電導率升高。溫度對反滲透各段的壓降也有一定的影響，溫度升高，水的粘度降低，壓降減少。
反滲透膜產水電導對進水水溫的變化十分敏感，隨著水溫的增加，水通量也線性增加，進水水溫每升高1℃，透過膜的水分子粘度下降、擴散性能增強，產水通量就增加2.5%～3.0%。進水水溫的升高，鹽分透過膜的擴散速度會因溫度的提高而加快，同樣會導致透鹽率的增加和脫鹽率的下降。
三、進水pH值：各種膜組件都有一個允許的pH值范圍，進水pH值對產水量幾乎沒有影響；但即使在允許范圍內，pH值對脫鹽率也有較大影響。一方面pH值對產品水的電導率也有一定的影響，由于反滲透膜本身大都帶有一些活性基團，pH值可以影響膜表面的電場進而影響到離子的遷移，pH值對進水中雜質的形態有直接影響，如對可離解的有機物，其截留率隨pH值的降低而下降；另一方面由于水中溶解的CO2受pH值影響較大，pH值低時以氣態CO2形式存在，容易透過反滲透膜，所以pH低時脫鹽率也較低，隨pH升高，氣態CO2轉化為HCO3-和CO32-離子，脫鹽率也逐漸上升，pH在7.5～8.5之間時，脫鹽率達到最高。
四、進水鹽濃度：滲透壓是水中所含鹽分或有機物濃度的函數，含鹽量越高滲透壓也增加，進水壓力不變的情況下，凈壓力將減小，產水量降低。透鹽率正比于反滲透膜正反兩側鹽濃度差，進水含鹽量越高，濃度差也越大，透鹽率上升，從而導致脫鹽率下降。對同一系統來說，給水含鹽量不同，其運行壓力和產品水電導率也有差別，給水含鹽量每增加l00ppm，進水壓力需增加約0.007MPa，同時由于濃度的增加，產品水電導率也相應的增加。
