1、多段組合處理：當水源水質當中含鹽量不是很高的時候，為了能夠獲得較高的回收率，可以采用多段組合型式。第一段的濃水進入第二段作為進水原液，然后將兩段的滲透出水混合作為產品水。在必要的時候，可以再增加一段，即將第二段濃水作為第三段的進水，第三段滲透出水與前兩段出水匯合成成品水質。這種方式的優點就是可以有效降低水耗，提高水質的回收率。
2、帶中間升壓泵的三段連接方式。在水源特別缺乏的地區，為了盡可能節約用水量，即使水源水質較差，含鹽較高，也希望獲得較高的回收率。此時，在多段組合的各段之間，必須起置高壓泵，以保證壓差達到最終目標的要求值。
3、多級串聯處理：當水源水中含鹽量較高的時候，并且對于反滲透出水水質要求又比較高時，便可以采用多級串聯的方式，即將第一級出水作為第二級的進水。采用這種水處理方式進行操作，第二級的排水水質遠相較第一級的進水水質優異，可與第一級的進水混合作為進水原水。在幾級串聯型式當中，需要有中間貯水箱以及高壓泵等設備裝置。
